Mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica - Mechanisms of action of biolocally active compounds

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Mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica - Mechanisms of action of biolocally active compounds

Objetivos

1.- Identificación y caracterización del mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica.
2.- Expresión y purificación de dianas farmacológicas.
3.- Análisis bioinformático de dianas farmacológicas.
4.- Caracterización estructural de biomoléculas.
5.- Modelado de ligandos y cribado virtual.
6.- Simulación por ordenador de los complejos ligando-receptor.
7.- Desarrollo de ensayos bioquímicos para la evaluación de la actividad biológica.


Investigadores

Jiménez Ruiz, Antonio

Jiménez Ruiz, Antonio

C.U. de Bioquímica y Biología Molecular

Miembro del Comité Asesor para el Desarrollo del Plan Estratégico de la UAH

Catedrático de Universidad

Biología de Sistemas

Más información

Gago Badenas, Federico

Gago Badenas, Federico

C.U. de Farmacología

Catedrático de Universidad

Ciencias Biomédicas

http://www3.uah.es/farmamol/

Más información


Camarasa , M.J.

Camarasa , M.J.


Velázquez , Sonsoles

Velázquez , Sonsoles


Mercado Objetivo

Industria Farmacéutica y Biotecnológica.


Lineas de investigación

  • Estudios conformacionales de fármacos y péptidos
  • Farmacología molecular
  • Interacción Fármaco-Receptor
  • Mecanismo de acción de compuestos antitumorales
  • Mecanismos del proceso de muerte celular programada en el
    parásito protozoo Leishmania

Equipamiento

Citómetro de flujo.
Estaciones de trabajo con gráficos moleculares.
Servidores de cálculo científico.
Sistemas de electroforesis.
Cultivos celulares.
Microscopio de fluorescencia.
Equipos de cromatografía líquida rápida de proteínas (FPLC).


Servicios

Ensayo de unión de ligandos a los receptores nucleares.
Identificación y caracterización del mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica.
Expresión y purificación de dianas farmacológicas.
Análisis bioinformático de dianas farmacológicas.
Caracterización estructural de biomoléculas.
Modelado de ligandos y cribado virtual.
Simulación por ordenador de los complejos ligando-receptor.
Desarrollo de ensayos bioquímicos para la evaluación de la actividad biológica.


Proyectos de Investigación

  • Título: Adquisición cromatógrafo Akta Start
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 30/05/2019
    Fecha Fin: 20/12/2019
    Entidad financiadora: Universidad de Alcalá
    Cuantia económica: 7505.97
  • Título: Plataforma para el desarrollo de estrategias de Control de Salud Animal
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Otros Investigadores: BRAVO GARCÍA, Ana; GAGO BADENAS, Federico; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; GARCÍA SORIANO, Juan Carlos; LÓPEZ GUTIÉRREZ, Celia;
    Fecha Inicio: 01/01/2019
    Fecha Fin: 31/12/2022
    Entidad financiadora: COMUNIDAD AUTONOMA DE MADRID
    Cuantia económica: 45565.73
  • Título: Plataforma para el desarrollo de estrategias de Control de Salud Animal
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Otros Investigadores: BRAVO GARCÍA, Ana; GAGO BADENAS, Federico; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; GARCÍA SORIANO, Juan Carlos; LÓPEZ GUTIÉRREZ, Celia;
    Fecha Inicio: 01/01/2019
    Fecha Fin: 31/12/2022
    Entidad financiadora: COMUNIDAD AUTONOMA DE MADRID
    Cuantia económica: 45565.73
  • Título: GENERACIÓN DE UN PORTAFOLIOS DE NUEVAS ENTIDADES QUÍMICAS FRENTE A LEISHMANIASIS, INFECCIONES VIRICAS EMERGENTES Y CÁNCER (LEISHVIRCAN)
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; BRAVO GARCÍA, Ana; GARCÍA SORIANO, Juan Carlos; MILLS FERNÁNDEZ, Alberto;
    Fecha Inicio: 01/01/2019
    Fecha Fin: 31/12/2019
    Entidad financiadora: Universidad de Alcalá
    Cuantia económica: 4500
  • Título: GENERACIÓN DE UN PORTAFOLIOS DE NUEVAS ENTIDADES QUÍMICAS FRENTE A LEISHMANIASIS, INFECCIONES VIRICAS EMERGENTES Y CÁNCER (LEISHVIRCAN)
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; BRAVO GARCÍA, Ana; GARCÍA SORIANO, Juan Carlos; MILLS FERNÁNDEZ, Alberto;
    Fecha Inicio: 01/01/2019
    Fecha Fin: 31/12/2019
    Entidad financiadora: Universidad de Alcalá
    Cuantia económica: 4500
  • Título: Plataforma para el desarrollo de estrategias de control de Salud Animal
    Referencia: P2018/BAA-4370
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Otros Investigadores: LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; BRAVO GARCÍA, Ana; GARCÍA SORIANO, Juan Carlos; LÓPEZ GUTIÉRREZ, Celia;
    Fecha Inicio: 01/01/2019
    Fecha Fin: 31/12/2022
    Entidad financiadora: CONSEJERIA DE EDUCACION, JUVENTUD Y DEPORTE
    Cuantia económica: 999683.94

Propiedad Industrial e Intelectual

Sin información de Propiedad Industrial e Intelectual


Publicaciones

Libros

Sin información de Libros


Artículos

Sin información de Artículos


Artículos Electrónicos

Sin información de Artículos Electrónicos


Capítulos

Sin información de Capítulos



Congresos

  • GARCÍA , Sonia; CAMARASA , María José; VELÁZQUEZ , Sonsoles; REVUELTO , Alejandro; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; GARCÍA , Juan Carlos; CARRILES , Alejandra; GUTIÉRREZ , Kilian Jesús; GAGO BADENAS, Federico; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; HERMOSO , Juan; ."Optimization of a convergent synthetic route to modify the central phenyl ring of 5-6-5 triazole-phenyl-thiazole as trypanothione reductase dimerization modulators". Nacional. "VI Simposio de Jóvenes Investigadores de la SEQT". Tres Cantos (21/06/2019 - ).
  • ALZATE , J.F.; ALVAREZ BARRIENTOS , A.; GONZALEZ , V.M.; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Analysis of the heat-induced cell death in Leishmania by flow-cytometry". Internacional. "Worldleish 3". "(Italia)". (10/04/2005 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Estudios ‘in silico' de las interacciones ligando-receptor: aplicaciones al diseño y optimización de fármacos.". Nacional. "XIII Congreso Nacional de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Santiago (09/09/2003 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Yondelis® [trabectedin, ET-743". Nacional. "IV PharmaMar MoA Symposium". Madrid (20/01/2003 - ).
  • MARCO TEJÓN, Esther; GARCÍA-NIETO MORENO, Raquel; MANZANARES , I.; CUENCA FERNÁNDEZ, Eduardo; GAGO BADENAS, Federico; ."Structural similarity between zinc finger-DNA complexes and DNA complexes containing three tandemly bound ecteinascidin ET743 molecules. (Póster)". Internacional. "International Conference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics". "(Estados Unidos)". (29/10/2002 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Discovering new drug candidates in the postgenomic era". Internacional. "III Jornadas de Bioinformática- International Symposium on Bioinformatics and Computational Biology.". (18/09/2002 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; .""Docking" y "ranking": dos asignaturas pendientes en el modelado molecular de complejos ligando-receptor.". Nacional. "Reunió de la Xarxa de Modelització Molecular.". Barcelona (24/01/2002 - ).
  • MENDIETA GÓMEZ, Jesús; RAMIREZ , Galo; GAGO BADENAS, Federico; ."Simulaciones mediante dinámica molecular de los cambios conformacionales del receptor de Glutamato en presencia y ausencia de agonistas". Nacional. "XXIV Congreso Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular". Valencia (18/09/2001 - ).
  • GARCÍA-NIETO MORENO, Raquel; MARCO TEJÓN, Esther; MANZANARES , A.; CUEVAS , I.; GAGO BADENAS, Federico; ."Avances en la química y biología de las ecteinascidinas, una nueva y prometedora clase de agentes antitumorales". Nacional. "XXIV Congreso de la Sociedad Española de Bioquímca y Biología Molecular". Valencia (18/09/2001 - ).
  • MENDIETA GÓMEZ, Jesús; PRIEGO , Eva Mª; PEREZ-PEREZ , Mª Jesus; CAMARASA , Mª Jose; GAGO BADENAS, Federico; ."Timidina fosforilasa: un blanco para el diseño de nuevos fármacos anti-angiogénicos". Nacional. "XII Congreso Nacional de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Sevilla (11/09/2001 - ).
  • SSAN-FELIX , A.; CHAMORRO , C.; LUENGO , S.M.; PEREZ-PEREZ , M.J.; GAGO BADENAS, Federico; JIMENO , M.L.; CAMARAZA , M.J.; ."Síntesis y estudio conformacional de nuevos biciclo y triciclo nucleósidos". Nacional. "XII Congreso nacional de la Sociedad Química Terapéutica". Sevilla (11/09/2001 - ).
  • MENDIETA GÓMEZ, Jesús; RAMIREZ , Galo; GAGO BADENAS, Federico; ."Simulaciones mediante dinámica molecular de los cambios conformacionales del receptor de Glutamato en presencia y ausencia de agonistas". Nacional. "XII Congreso Nacional de la Sociedad Española de Química Terapeútica". Sevilla (11/09/2001 - ).
  • MARCO TEJÓN, Esther; GARCÍA-NIETO MORENO, Raquel; GAGO BADENAS, Federico; ."Transición B®A en el ADN tras la unión cabeza-cola de tres moléculas de ecteinascidina ET743 a tres sitios adyacentes en el promotor proximal del gen p73 humano". Nacional. "III Reunión de Acidos Nucleicos y Nucleósidos (RANN III)". Santiago (19/07/2001 - ).
  • GARCÍA-NIETO MORENO, Raquel; MARCO TEJÓN, Esther; GAGO BADENAS, Federico; ."Reconocimiento de secuencias de ADN por dedos de zinc: comparación entre los factores de transcripción EGR-1(Zif-268) y Sp1". Nacional. "III Reunión de Ácidos Nucleicos y Nucleósidos (RANN III)". Santiago (19/07/2001 - ).
  • MARCO TEJÓN, Esther; GARCÍA-NIETO MORENO, Raquel; GAGO BADENAS, Federico; ."Unión cabeza-cola de tres moléculas de Ecteinascidina ET743 a tres sitios adyacentes en el promotor próximal del gen P73 humano". Nacional. "X Jornada de farmacólogos de la Comunidad de Madrid". Madrid (30/05/2001 - ).
  • MENDIETA GÓMEZ, Jesús; RAMIREZ , Galo; GAGO BADENAS, Federico; ."Simulaciones mediante dinámica molecular de los cambios conformacionales del receptor de Glutamato en presencia y ausencia de agonistas". Nacional. "X Jornada de farmacólogos de laComunidad de Madrid". Madrid (30/05/2001 - ).
  • GARCÍA-NIETO MORENO, Raquel; MANZANARES , I.; CUEVAS MARCHANTE , Carmen; GAGO BADENAS, Federico; ."From sequence to structure to function: the importance of overlapping binding sites for zinc finger-containing proteins on transcription regulation and possible modulation by anticancer ecteinascidins.". Internacional. "International Meetings on Biology, Workshop on Structural Genomics and Bioinformatics". Madrid (12/03/2001 - ).
  • GARCÍA-NIETO MORENO, Raquel; MANZANARES , I.; NO_INFORMADO , CUEVAS MARCHANTE, CARMEN; GAGO BADENAS, Federico; ."From sequence to structure to function: the importance of overlapping binding sites for zinc finger-containing proteins on transcription regulation and possible modulation by anticancer ecteinascidins". Nacional. "International Meetings on Biology, Workshop on Structural Genomics and Bioinformatics". Madrid (12/03/2001 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."A Zinc Finger-induced DNA Bend is a Likely Target for Antitumour Ecteinascidin ET473". Internacional. "STRUCTURE-BASED DRUG DESIGN". "(Reino Unido)". (15/12/2000 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Herramientas computacionales utilizadas en el diseño de fármacos basado en la estructura del receptor". Nacional. "Estrategias y nuevas tecnologías para el descubrimiento de fármacos". Toledo (26/10/2000 - ).
  • KMUNICEK , J.; LUENGO , S.; GAGO BADENAS, Federico; RAMÍREZ ORTIZ, Ángel; WADE , R.; DAMBORSKY , J.; ."Application of Comparative Binding Energy (COMBINE) Analysis for the Design of Environmental Biocatalysts. (Presentación oral).". Internacional. "QSAR 2000". "(Bulgaria)". (16/09/2000 - ).
  • RINCÓN , E.; MORENO , M.; FERNANDEZ , G.; JIMENEZ , S.; RUIZ , S.; VEGA RAMIRO, Juan Antonio; GAGO BADENAS, Federico; VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; DOMINGO GALÁN, Alberto; ."Diseño de patrones para PCR competitiva.". Nacional. "XXIII Congreso de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular". Granada (13/09/2000 - ).
  • KMUNICEK , J.; DAMBORSKY , J.; WADE , R.; LUENGO , S.; GAGO BADENAS, Federico; RAMÍREZ ORTIZ, Ángel; ."Design of Haloalkane Dehalogenase Using Comparative Binding Energy (COMBINE) analysis. (Presentación en póster)". Internacional. "5th International Symposium and Exhibition on Enrironmental Contamination in Central and Eastern Europe". Praga "(República Checa)". (12/09/2000 - ).
  • GARCÍA NAVÍO, José L.; ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; GAGO BADENAS, Federico; DOMINGO GALÁN, Alberto; VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; ."Nuevos intercalantes de ADN basados en el sistema de aza-quinolizinio". Nacional. "II Reunión Nacional de Nucleósidos y Nucleótidos". San Lorenzo de el Escorial (22/10/1999 - ).
  • CAMARAZA , M.J.; PEREZ-PEREZ , M.J.; VELAZQUEZ , S.; SAN FELIX , A.; JIMENO , M.L.; ALVAREZ , R.; CHAMORRO , C.; LOBATON , E.; TUÑON , V.; PEREZ , C.; GAGO BADENAS, Federico; DE CLERQ , E.; BALZARINI , L.; ."HIV-1 reverse transcriptase inhibitors: why are TSAO derivatives so unique?". Internacional. "First Euroconference on Carbohydrates in Drug Research". "(Italia)". (16/09/1999 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Molecular modeling: From Pharmacology to Chemistry". Nacional. "XXII National Congress of the Spanisch Society of Pharmacology - XI National Congress of the Spanisch Society of Therapeutic Chemistry". Valencia (14/09/1999 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Uso de estructuras cristalográficas en el modelado molecular: aplicación al reconocimiento fármaco-receptor". Nacional. "XI Symposium del grupo especializado de cristalografía". Alcalá de Henares (09/06/1999 - ).
  • DEL ALAMO , M.; PÉREZ , A; CALVO , M.; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; GONZÁLEZ , V.M.; ALONSO , C.; DELGADO-IRIBARREN , A.; ."Evaluation of recombinant antigens and commercial assays for the diagnosis of Leishmaniasis". Conferencia. Internacional. "XXXVIII INTERSCIENCE CONFERENCE ON ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHHERAPY". San Diego "(Estados Unidos)". (09/1998 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Comparative binding energy (COMBINE) analysis: Developmkent and improvements". Internacional. "Talking proteins: An EMBO Workshop on Sequence Analysis, Modelling and Simulation". "(Alemania)". (16/09/1998 - ).
  • GARCIA NIETO , R.; PEREZ , C.; CHECA , A.; GAGO BADENAS, Federico; ."Molecular model of the interaction between nimesulide and human cyclooxygenase". Internacional. "11th EULAR Symposium (The European League Against Rheumatism)". "(Suiza)". (05/09/1998 - ).
  • PASTOR , M.; GAGO BADENAS, Federico; CRUCIANI , G.; ."Comparative Binding Energy (COMBINE) Analysis on a Series of Clycogen Phosphorylase Inhibitors. Comparison with GRID/GOLPE Models". Internacional. "12th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationship: Molecular Modelling and Prediction of Bioactivity". "(Dinamarca)". (23/08/1998 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Método COMBINE aplicado al análisis de la interacción fármaco-receptor". Nacional. "IMIM". Barcelona (25/06/1998 - ).
  • PASTOR , M.; PEREZ , C.; GAGO BADENAS, Federico; ."Sturcture-based QSAR models of a symmetic receptor. Simulating alternative binding of the ligands". Internacional. "The Second Electronic Molecular Graphics and Modelling Conference-Virtual Environments International (VEI)". Oxford "(Reino Unido)". (01/11/1997 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Modelado molecular de la interacción DNA y fármacos antitumorales". Nacional. "Jornadas sobre Interacción de Ácidos Nucleicos con otras Biomoléculas: de la Biología a la Química". Sevilla (30/10/1997 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Modelado molecular". Internacional. "Reunión de Ácidos Nucleicos y Nucleósidos". Girona (17/10/1997 - ).
  • MOLINA , A.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • MOLINA PONCE, Andrés; PASTOR FERNÁNDEZ, Joaquín A.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • PASTOR , J.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • GARCÍA NAVÍO, José L.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • GARCIA-NAVIO , J.L.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; DE PASCUAL TERESA , B.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • DE PASCUAL TERESA , B.; GAGO BADENAS, Federico; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; RODRIGO LÓPEZ, M. Melia; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • RODRIGO , M.M.; ."Nuevos agentes bis-intercalantes de ADN". Nacional. "X Congreso de la Sociedad Española de Química Terapéutica". Oviedo (23/09/1997 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."Modelo Molecular de la Interacción entre la Nimesulida y la ciclooxigenasa 2 humana". Internacional. "III Symposium Internacional III Symposium Internacional de Reumatología - V Symposium de Inflamación". Sevilla (10/04/1997 - ).
  • GAGO BADENAS, Federico; ."A computational approach to DNA recognition by intercalating and bis-intercalating ligands". Internacional. "European Research Conference-Supramolecular Chemistry: Molecular Recognition and Drug-Receptor Interactions". Salamanca (29/08/1996 - ).
  • CHECA , A.; ORTIZ , A.R.; PASCUAL TERESA , B.; GAGO BADENAS, Federico; ."Approximating calculated binding energy differences for enzyme-inhibitor complexes to experimental values". Internacional. "York Meeting on Molecular Interactions". York "(Reino Unido)". (16/04/1996 - ).
  • RAMIREZ , A.; PISABARRO , M.T.; GAGO BADENAS, Federico; ."Toward a more rational design of enzyme inhibitors: phospholipase A2 as a test case". Internacional. "Int. Meeting on Biology, Workshop on Computational Approaches in the Analysis and Engineering of Proteins". Madrid (14/11/1994 - ).
  • CARCELLER MARTÍ, Rosa; IZQUIERDO CEINOS, M. Luisa; GARCÍA NAVÍO, José L.; GAGO BADENAS, Federico; ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; ."Iluros de 1-(2-Piridilimino)piridinio, Nuevos Reactivos para a Obtencion de 2-Aminopiridinas". Jornada. Nacional. "VI Jornadas de Química Orgánica". Murcia (1992 - ).

Tesis

Sin información de Tesis