Mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica

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Mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica

Objetivos

1.- Identificación y caracterización del mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica.
2.- Expresión y purificación de dianas farmacológicas.
3.- Análisis bioinformático de dianas farmacológicas.
4.- Caracterización estructural de biomoléculas.
5.- Modelado de ligandos y cribado virtual.
6.- Simulación por ordenador de los complejos ligando-receptor.
7.- Desarrollo de ensayos bioquímicos para la evaluación de la actividad biológica.


Investigadores

Gago Badenas, Federico

Gago Badenas, Federico

C.U. de Farmacología

Catedrático de Universidad

Ciencias Biomédicas

http://www3.uah.es/farmamol/

Más información

Alzate ., Juan Fernando

Alzate ., Juan Fernando


Arias Sierra, Andrés Augusto

Arias Sierra, Andrés Augusto


Jiménez Ruiz, Antonio

Jiménez Ruiz, Antonio

C.U. de Bioquímica y Biología Molecular

Director/a del Departamento de Biología de Sistemas

Catedrático de Universidad

Biología de Sistemas

Más información


Moreno Mateos, David

Moreno Mateos, David

Personal Investigador (Contrato Proyecto

Farmacología


Negri Martínez, Ana

Negri Martínez, Ana


Ramírez Sánchez-Escobar, José Julio

Ramírez Sánchez-Escobar, José Julio

Personal investigador en formación

Farmacología


Rico Vidal, Eva

Rico Vidal, Eva

Personal investigador en formación

Farmacología


Genes Robles, Carlos Mario

Genes Robles, Carlos Mario

Personal con contrato Predoctoral

Biología de Sistemas

carlos.genes@edu.uah.es


Lineas de investigación

  • Estudios conformacionales de fármacos y péptidos
  • Farmacología molecular
  • Interacción Fármaco-Receptor
  • Mecanismo de acción de compuestos antitumorales
  • Mecanismos del proceso de muerte celular programada en el parásito protozoo Leishmania

Equipamiento

Citómetro de flujo.
Estaciones de trabajo con gráficos moleculares.
Servidores de cálculo científico.
Sistemas de electroforesis.
Cultivos celulares.
Microscopio de fluorescencia.
Equipos de cromatografía líquida rápida de proteínas (FPLC).


Servicios

Ensayo de unión de ligandos a los receptores nucleares.
Identificación y caracterización del mecanismo de acción de moléculas con actividad biológica.
Expresión y purificación de dianas farmacológicas.
Análisis bioinformático de dianas farmacológicas.
Caracterización estructural de biomoléculas.
Modelado de ligandos y cribado virtual.
Simulación por ordenador de los complejos ligando-receptor.
Desarrollo de ensayos bioquímicos para la evaluación de la actividad biológica.


Resultado

JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. GAGO BADENAS, Federico. "Nucleósidos modificados para el tratamiento de infecciones por Leishmania". Patente de invención. Nº de solicitud: 200803551. Oficina Española de Patentes y Marcas.

VAQUERO LÓPEZ, Juan J.. ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio. RODRÍGUEZ PUYOL, Diego. RODRÍGUEZ PUYOL, Manuel. ALAJARÍN FERRÁNDEZ, Ramón. SÁNCHEZ ALONSO, Patricia. GRIERA MERINO, Mercedes. DÍEZ MARQUÉS, María Luisa. JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. MORENO MATEOS, David. GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús. "Sales de piridazino[2,3-a]pirrolo[2, 1-c]quinoxalinio para el tratamiento de infecciones por leishmania y enfermedades en las que está implicada la Proteína Tirosina Fosfatasa 1B". Patente de invención. Nº de solicitud: P201331052.

VAQUERO LÓPEZ, Juan J.. ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio. ALAJARÍN FERRÁNDEZ, Ramón. SÁNCHEZ ALONSO, Patricia. JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús. MORENO MATEOS, David. "Compuestos para el tratamiento de infecciones por Leishmania". Patente de invención. Nº de solicitud: P201331081.

VAQUERO LÓPEZ, Juan J.. JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio. ALAJARÍN FERRÁNDEZ, Ramón. RODRÍGUEZ PUYOL, Diego. RODRÍGUEZ PUYOL, Manuel. SÁNCHEZ ALONSO, Patricia. GRIERA MERINO, Mercedes. "Salts of pyridazino[2,3-a]pyrrolo[2,1-c]quinoxaline for the treatment of leishmania infections and diseases that involve the protein tyrosine phosphatase 1B ". PROPIEDAD INTELECTUAL. Nº de solicitud: PCT/ES2014/0705.

2015.
ALAJARÍN FERRÁNDEZ, Ramón. VAQUERO LÓPEZ, Juan J.. ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio. SÁNCHEZ ALONSO, Patricia. JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús. MORENO MATEOS, David. "Sales de piridazino[2,3-a]pirrolo[2,1-c]quinoxalinio para el tratamiento de infecciones por Leishmania y enfermedades en las que está implicada la proteína tirosina fosfatasa 1B". Patente de invención. Nº de solicitud: PCT/ES2014/0705. Fecha de Concesión: 1421276460000.

2015.
RODRÍGUEZ PUYOL, Diego. ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio. VAQUERO LÓPEZ, Juan J.. JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. ALAJARÍN FERRÁNDEZ, Ramón. RODRÍGUEZ PUYOL, Manuel. DÍEZ MARQUÉS, María Luisa. GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús. GRIERA MERINO, Mercedes. SÁNCHEZ ALONSO, Patricia. MORENO MATEOS, David. "Sales de piridazino[2,3-a]pirrolo[2,1-c]quinoxalinio para el tratamiento de infecciones por Leishmania y enfermedades en las que está implicada la proteína tirosina fosfatasa 1B.". Patente de invención. Nº de solicitud: P201331052. Oficina Española de Patentes y Marcas. Fecha de Concesión: 1420153800000.

2011.
JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. , CAMARASA RIUS M JOSE. GAGO BADENAS, Federico. CASANOVA MALPICA, Elena. MORENO MATEOS, David. PÉREZ PÉREZ, María Jesús. RICO GALÁN, Eva. "Derivados de nucleósidos para el tratamiento de infecciones por Leishmania". Patente de invención. Nº de solicitud: P200803552. Oficina Española de Patentes y Marcas. Fecha de Concesión: 1294959840000.

2011.
JIMÉNEZ RUIZ, Antonio. GAGO BADENAS, Federico. "Derivados de nucleósidos para el tratamiento de infecciones por Leishmania". Patente de invención. Nº de solicitud: 200803552. Oficina Española de Patentes y Marcas. Fecha de Concesión: 1294959840000.

Proyectos de Investigación

  • Título: CARACTERIZACION Y BLOQUEO MEDIANTE PEPTIDOS Y MOLECULAS PEQUEÑAS DE PROTEINAS DIANA IMPLICADAS EN LAPROLIFERACION DE MICROORGANISMOS PATOGENOS Y CELUAS CANCEROSAS
    Referencia: SAF2015-64629-C2-2-R
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/01/2016
    Fecha Fin: 31/12/2018

  • Título: Búsqueda del Mecanismo de Acción de Plitidepsina y PM01183 mediante Herramientas Bioinformáticas y Métodos de Simulación Moledcular
    Referencia: 8/2016
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2016
    Fecha Fin: 31/12/2016
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 24200
  • Título: Modelado molecular de reacciones enzimáticas II
    Referencia: 91/2015
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro;
    Fecha Inicio: 19/10/2015
    Fecha Fin: 15/12/2015
    Entidad financiadora: REPSOL S.A.
    Cuantia económica: 24200
  • Título: Modelado molecular de reacciones enzimáticas de interés para la Química
    Referencia: 14/2015
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 10/03/2015
    Fecha Fin: 09/07/2015
    Entidad financiadora: REPSOL, S.A.
    Cuantia económica: 30250
  • Título: Modelo Molecular de Reacciones Enzimáticas
    Referencia: 11/2014
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 24/03/2014
    Fecha Fin: 23/03/2015
    Entidad financiadora: REPSOL S.A.
    Cuantia económica: 66550
  • Título: Modelado Molecular de Reacciones Enzimáticas
    Investigador Principal: SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/03/2014
    Fecha Fin: 01/03/2015
    Entidad financiadora: Repsol YPF, S.A.

  • Título: Búsqueda del Mecanismo de Acción de Plitidepsina y PM01183 mediante Herramientas Bioinformáticas y Métodos de Simulación Molecular
    Referencia: 1/2014
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2014
    Fecha Fin: 31/12/2014
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 24200
  • Título: Integración de estrategias para el diseño y descubrimiento de ligandos con afinidad por dianas de interés terapéutico en enfermedades de alta prevalencia o abandonadas (SAF2012-39760-C02-02)
    Otros Investigadores: CORTÉS CABRERA, Álvaro; GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2013
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: Ministerio de Economia y Competitividad

  • Título: Herramientas computacionales para simulaciones biomoleculares y diseño de fármacos basado en la estructura tridimensional de dianas y ligandos (UNAH13-4E-2006)
    Otros Investigadores: CORTÉS CABRERA, Álvaro; GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2013
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: Ministerio de Economia y Competitividad

  • Título: Herramientas computacionales para simulaciones biomoleculares y diseño de fármacos basado en la estructura tridimensional de dianas y ligandos
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; COLÁS ESCUDERO, Begoña; VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús; CHILOECHES GÁLVEZ, Antonio; TORO LONDOÑO, Miguel Ángel; OLIVA CORREIA, Cristina; CORTÉS CABRERA, Álvaro; ROPERO SALINAS, Santiago;
    Fecha Inicio: 01/01/2013
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD
    Cuantia económica: 9939.78
  • Título: Herramientas computacionales para simulaciones biomoleculares y diseño de fármacos basado en la estructura tridimensional de dianas y ligandos
    Referencia: UNAH13-4E-2006
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; COLÁS ESCUDERO, Begoña; ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús; CHILOECHES GÁLVEZ, Antonio; TORO LONDOÑO, Miguel Ángel; OLIVA CORREIA, Cristina; CORTÉS CABRERA, Álvaro; ROPERO SALINAS, Santiago;
    Fecha Inicio: 01/01/2013
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD
    Cuantia económica: 9939.78
  • Título: Integración de estrategias para el diseño y descubrimiento de ligandos con afinidad por dianas de interés terapéutico en enfermedades de alta prevalencia o abandonadas
    Referencia: SAF2012-39760-C02-02
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: GENES ROBLES, Carlos Mario; CORTÉS CABRERA, Álvaro; GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; MORREALE DE LEÓN, Antonio; TORO LONDOÑO, Miguel Ángel;
    Fecha Inicio: 01/01/2013
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD
    Cuantia económica: 152100
  • Título: Búsqueda del Mecanismo de Acción de Plitidepsina y PM01183 Mediante Herramientas Bioinformáticas y Métodos de Simulación Molecular
    Referencia: 8/2013
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2013
    Fecha Fin: 31/12/2013
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 24200
  • Título: Integración de estrategias para el diseño y descubrimiento de ligandos con afinidad por dianas de interés terapéutico en enfermedades de alta prevalencia o abandonadas
    Referencia: SAF2012-39760-C02-02
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús; GENES ROBLES, Carlos Mario; CORTÉS CABRERA, Álvaro; TORO LONDOÑO, Miguel Ángel; MORREALE DE LEÓN, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/01/2013
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD
    Cuantia económica: 0
  • Título: Desarrollo de un método para la generación de campos de fuerza ab initio para estados excitados y su implementación en AMBER: Aplicación al estudio del proceso de transferencia de energía triplete-triplete mediado por enlaces de hidrógeno en el ADN
    Investigador Principal: FRUTOS GAITE, Luis Manuel;
    Otros Investigadores: GAGO BADENAS, Federico; CASTAÑO GONZÁLEZ, Obis D; PALMEIRO URIACH, Raúl; TEMPRADO MORENA, Manuel; MARAZZI , Marco; GARCÍA IRIEPA, Cristina; FERNÁNDEZ GONZÁLEZ, Miguel Ángel; ZAPATA RUIZ, Felipe;
    Fecha Inicio: 01/03/2012
    Fecha Fin: 28/02/2013
    Entidad financiadora: UNIVERSIDAD DE ALCALA
    Cuantia económica: 10000
  • Título: BIPEDD-2. Bioinformatics Integrative Plataform for structurE-based Drug Discovery
    Otros Investigadores: SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2012
    Fecha Fin: 31/12/2014
    Entidad financiadora: Comunidad de Madrid

  • Título: Plataforma integrada de bioinformática para el descubrimiento de nuevos fármacos basado en la estructura del receptor
    Referencia: S2010/BMD-2457
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/01/2012
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: CONSEJERIA EDUCACION Y CULTURA (Comunidad de Madrid)

  • Título: Plataforma integrada de bioinformática para el descubrimiento de nuevos fármacos basado en la estructura del receptor
    Referencia: S2010/BMD-2457
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2012
    Fecha Fin: 31/12/2015
    Entidad financiadora: JUNTA CASTILLA Y LEON-SERVICIOS TERRITORIALES
    Cuantia económica: 105355.19
  • Título: Biomarcadores de Tubulina en la Acción Antitumoral de PM050489 y PM060184
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2012
    Fecha Fin: 31/12/2012
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 35400
  • Título: Desarrollo de un metodo para la generación de campos de fuerza ab initio para estados excitados y su implementación en Amber: aplicacón al estudio del proceso de transferencia de energía triplete-triplete mediado por enlaces de hidrógeno en el ADN
    Investigador Principal: FRUTOS GAITE, Luis Manuel;
    Otros Investigadores: GAGO BADENAS, Federico; CASTAÑO GONZÁLEZ, Obis D.; PALMEIRO URIACH, Raúl; TEMPRADO MORENA, Manuel; MARAZZI , Marco; GARCÍA IRIEPA, Cristina; FERNÁNDEZ GONZÁLEZ, Miguel Ángel; ZAPATA RUIZ, Felipe;
    Fecha Inicio: 01/01/2012
    Fecha Fin: 31/12/2012

  • Título: ESTUDIOS ESTRUCTURALES Y SIMULACIONES DE DINÁMICA MOLECULAR DE LA UNIÓN DE SUSTRATOS E INHIBIDORES A DISTINTAS ENZIMAS IMPLICADAS EN PROCESOS PATOLÓGICOS VINCULADOS CON EL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 16/04/2010
    Fecha Fin: 31/12/2010
    Entidad financiadora: NOSCIRA, S.A.
    Cuantia económica: 24885.9
  • Título: Modo de unión de la molécula PM060184 a la tubulina utilizando métodos de simuŽlación
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/04/2010
    Fecha Fin: 31/12/2011
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 47200
  • Título: Soluciones Innovadoras para acelerar la identificación y desarrollo de fármacos para patologías del Sistema Nervioso
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2010
    Fecha Fin: 31/08/2014
    Entidad financiadora: NOSCIRA, S.A.
    Cuantia económica: 104589.3
  • Título: Agentes quimioterapéuticos frente a Leishmania. Cribado de nuevos compuestos y exploracion de mecanismos novedosos para la inhibición de tripanotión reductasa y endoG
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Otros Investigadores: GAGO BADENAS, Federico; RICO VIDAL, Eva; BUEREN CALABUIG, Juan Antonio; CODERCH BOUE, Claire; GENES ROBLES, Carlos Mario;
    Fecha Inicio: 01/01/2010
    Fecha Fin: 31/12/2013
    Entidad financiadora: JUNTA DE COMUNIDADES DE CASTILLA-LA MANCHA
    Cuantia económica: 120000
  • Título: BÚSQUEDA DEL MECANISMO DE ACCIÓN DE APLIDINA, TIOCORALINA Y TRABECTEDINA MEDIANTE HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS Y MÉTODOS DE SIMULACIÓN MOLECULAR
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2010
    Fecha Fin: 31/12/2010
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 34800
  • Título: AGENTES QUIMIOTERAPEUTICOS FRENTE APATOGENOS AMPLIAMENTE DISEMINADOS (VIH Y LEISHMANIA): EXPLORANDO NUEVAS DIANAS Y/O NUEVOS MECANISMOS DE INHIBICION
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; MORENO MATEOS, David; RICO VIDAL, Eva; GUTIÉRREZ VIÑAS, Kilian Jesús; BUEREN CALABUIG, Juan Antonio; CODERCH BOUE, Claire; PALAFOX SÁNCHEZ, Marta; GENES ROBLES, Carlos Mario;
    Fecha Inicio: 01/01/2010
    Fecha Fin: 31/12/2012
    Entidad financiadora: MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD
    Cuantia económica: 183920
  • Título: ESTUDIOS ESTRUCTURALES Y SIMULACIONES DE DINAMICA MOLECULAR DE LA UNION DE SUSTRATOS E INHIBIDORES A DISTINTAS ENZIMAS IMPLICADAS EN PROCESOS PATOLOGICOS VINCULADOS CON EL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 02/03/2009
    Fecha Fin: 31/12/2009
    Entidad financiadora: NOSCIRA
    Cuantia económica: 24824
  • Título: BUSQUEDA DEL MECANISMO DE ACCION DE APLIDINA, TIOCORALINA Y TRABECTEDINA MEDIANTE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS Y METODOS DE SIMULACION MOLECULAR
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2009
    Fecha Fin: 31/12/2009
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 34800
  • Título: ESTUDIO DEL EFECTO DE APLIDIN SOBRE LA INCORPORACION DE SELENOCISTEINA EN SELENOPROTEINAS
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/01/2009
    Fecha Fin: 31/12/2009
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 44080
  • Título: CRIBADO VIRTUAL DE INHIBIDORES FRENTE A DISTINTAS DIANAS TERAPEUTICAS Y SIMULACION DE LOS COMPLEJOS RESULTANTES
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/04/2008
    Fecha Fin: 01/04/2009
    Entidad financiadora: NOSCIRA, S.A.
    Cuantia económica: 24824
  • Título: BUSQUEDA DEL MECANISMO DE ACCION DE APLIDINA, TIOCORALINA, TRABECTEDINA MEDIANTE METODOS DE SIMULACION MOLECULAR (Prórroga)
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 02/01/2008
    Fecha Fin: 31/12/2008
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 34800
  • Título: ESTUDIO DEL EFECTO DE APLIDIN SOBRE LA INCORPORACION DE SELENOCISTEINA EN SELENOPROTEINAS
    Otros Investigadores: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/01/2008
    Fecha Fin: 01/01/2009
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.

  • Título: ESTUDIO DEL EFECTO DE APLIDIN SOBRE LA INCORPORACION DE SELENOCISTEINA EN SELENOPROTEINAS
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/01/2008
    Fecha Fin: 31/12/2008
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 38000
  • Título: CARACTERIZACIÓN DEL PROCESO DE MUERTE CELULAR EN EL PROTOZOO LEISHMANIA: CLONADO Y CARACTERIZACIÓN DE UNA HIPOTÉTICA ENDOG
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Otros Investigadores: NEGRI MARTÍNEZ, Ana; MORENO MATEOS, David; RICO VIDAL, Eva;
    Fecha Inicio: 01/01/2008
    Fecha Fin: 31/12/2008
    Entidad financiadora: JUNTA CASTILLA Y LEON-SERVICIOS TERRITORIALES
    Cuantia económica: 31765.12
  • Título: CRIBADO VIRTUAL Y OPTIMIZACION DE INHIBIDORES DE LA ENZIMA BETA-SECRETASA (BACE-1) Prórroga
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/02/2007
    Fecha Fin: 01/02/2008
    Entidad financiadora: NOSCIRA, S.A.
    Cuantia económica: 23751
  • Título: ESTUDIO DEL EFECTO DE APLIDIN SOBRE LA INCORPORACION DE SELENOCISTEINA EN SELENOPROTEINAS
    Investigador Principal: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/01/2007
    Fecha Fin: 31/12/2007
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 36366
  • Título: BIOINFORMATICS INTEGRATIVE PLATFORM FOR STRUCTURE - BASED DRUG DISCOVERY
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: RAMÍREZ ORTIZ, Ángel; , CUEVAS MARCHANTE, CARMEN; , JIMENEZ BARBERO, JESUS; , RAFAEL GIRALDO SUAREZ; LLORCA BLANCO, OSCAR A.; ANDREU MORALES , JOSÉ MANUEL; MORÁN ABAD , FEDERICO; CAMPOS OLIVAS , RAMÓN; , CAMARASA RIUS M JOSE; ROMERO GARRIDO , ANTONIO; DIAZ PEREIRA, JOSE FERNANDO; , CHACON MONTES PABLO; BRAVO SICILIA , JERÓNIMO; GARCIA PIDAL , VICTORIANO;
    Fecha Inicio: 01/01/2007
    Fecha Fin: 31/12/2010

  • Título: ESTRATEGIAS NO CONVENCIONALES PARA EL DESARROLLO DE PROFÁRMACOS E INHIBIDORES ENZIMÁTICOS: LA INTERFAZ PROTEINA-PROTEINA COMO DIANA FARMACOLÓGICA. 2, MODELADO, CRIBADO VIRTUAL Y EVALUACIÓN BIOLÓGICA
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: CRIADO FORNELIO, Ángel; MARCO TEJÓN, Esther; ALZATE RESTREPO, Juan F.; ARIAS SIERRA, Andrés Augusto; NEGRI MARTÍNEZ, Ana; RAMÍREZ SÁNCHEZ-ESCOBAR, José Julio; MORENO MATEOS, David; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio;
    Fecha Inicio: 01/10/2006
    Fecha Fin: 30/09/2009
    Entidad financiadora: DIRECCIÓN GENERAL DE INVESTIGACIÓN (MINISTERIO)
    Cuantia económica: 173393
  • Título: BUSQUEDA DEL MECANISMO DE ACCION DE APLIDINA, TIOCORALINA Y TRABECTEDINA MEDIANTE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS Y METODOS DE SIMULACION MOLECULAR
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Fecha Inicio: 01/01/2006
    Fecha Fin: 31/12/2007
    Entidad financiadora: PHARMA MAR, S.A.
    Cuantia económica: 65458.8
  • Título: ANÁLISIS COMPARATIVO DE ENERGÍAS DE UNIÓN SOBR ANÁLOGOS DE BALANOL COMO INHIBIDORES DE LA PROTEINA KINASA DEPENDIENTE DE AMP CÍCLICO: DESARROLLO DE INHIBIDORES DE LA EXPRESIÓN GÉNICA DEL VIH UTILIZANDO COMO DIANA MOLECULAR LA ACTIVACIÓN DE NF-KB
    Investigador Principal: GAGO BADENAS, Federico;
    Otros Investigadores: NEGRI MARTÍNEZ, Ana; RAMÍREZ SÁNCHEZ-ESCOBAR, José Julio;
    Fecha Inicio: 01/01/2006
    Fecha Fin: 31/12/2007

Tesis

  • TORO LONDOÑO, Miguel Ángel. "Diseño y evaluación de inhbidores peptídicos dirigidos a la interfaz de dimerización de la tripanotión reductasa de Leishmania infantum.Director: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio, GAGO BADENAS, Federico, . UNIVERSIDAD DE ALCALA. Fecha de lectura. : 30/06/2017. Sobresaliente cum laude.
  • GENES ROBLES, Carlos Mario. "Muerte celular similar a apoptosis en Leishmania spp: una aproximaciókn a su regulación.Director: JIMÉNEZ RUIZ, Antonio, . UNIVERSIDAD DE ALCALA. Fecha de lectura. : 19/07/2013. sobresaliente cum laude.
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Artículos

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  • CASADO , Jose A.; RIO , Paula; MARCO TEJÓN, Esther; GARCÍA HERNÁNDEZ, Verónica; DOMINGO GALÁN, Alberto; PÉREZ , Laura; TERCERO , Juan Carlos; VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; ALBELLA , Beatriz; GAGO BADENAS, Federico; BUEREN , Juan A.; ."Relevance of the Fanconi anemia pathway in the response of human cells to trabectedin". (ISSN: 1535-7163). Molecular Cancer Therapeutics. 2008. vol 7. num 5. p. 1309-1318.
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  • ALZATE , J.F.; ARIAS , A.A.; MORENO-MATEOS , D.; BARRIENTOS , A.A.; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Mitochondrial superoxide mediates heat-induced apoptotic-like death in Leishmania infantum". (ISSN: 0166-6851). Molecular and Biochemical Parasitology. 2007. vol 152. num 2. p. 192-202.
  • MARCO TEJÓN, Esther; GAGO BADENAS, Federico; ."Overcoming the Inadequacies or Limitations of Experimental Structures as Drug Targets by Using Computational Modeling Tools and Molecular Dynamics Simulations". (ISSN: 1860-7179). ChemMedChem. 2007. vol 2(10). p. 1388-1401.
  • NEGRI , Ana; MARCO TEJÓN, Esther; DAMBORSKY , Jiri; GAGO BADENAS, Federico; ."Stepwise dissection and visualization of the catalytic mechanism of haloalkane dehalogenase LinB using molecular dynamics simulations and computer graphics". (ISSN: 1093-3263). Journal of Molecular Graphics and Modelling. 2007. vol 26(3). p. 643-651.
  • NEGRI , Ana; MARCO TEJÓN, Esther; GAGO BADENAS, Federico; ."Antitumor Activity, X-ray Crystal Structure, and DNA Binding Properties of Thiocoraline A, a Natural Bisintercalating Thiodepsipeptide". (ISSN: 0022-2623). Journal of Medicinal Chemistry. 2007. vol 50(14). p. 3322-3333.

Artículos Electrónicos

Sin información de Artículos Electrónicos


Capítulos

  • CORTÉS CABRERA, Álvaro; SÁNCHEZ-MURCIA , Pedro A.; MORREALE DE LEÓN, Antonio; GAGO BADENAS, Federico; "Ligand-Based Drug Discovery and Design ". In Silico Drug Discovery and Design. (ISBN: 9781482217834.) 2015. p. 97. - 119.
  • CORTÉS CABRERA, Álvaro; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; MORREALE DE LEÓN, Antonio; GAGO BADENAS, Federico; "In Silico Drug Discovery and Design". Ligand-Based Drug Discovery and Design. (ISBN: 978-1-4822-1783-4.) 2015. p. 99. - 121.
  • CORTÉS CABRERA, Álvaro; GAGO BADENAS, Federico; MORREALE DE LEÓN, Antonio; "A Computational Fragment-Based De Novo Design Protocol Guided by Ligand Efficiency Indices (LEI) ". Fragment-Based Methods in Drug Discovery. (ISBN: 978-1-4939-2485-1.) 2015. p. 89. - 100.
  • GAGO MORILLO, María; GAGO BADENAS, Federico; "Glucocorticoides tópicos ". Terapéutica farmacológica de los trastornos dermatológicos, oftalmológicos y otológicos. Agentes farmacológicos de diagnóstico. Programa de actualización en Farmacología y Farmacoterapia.. Madrid. (ISBN: 978-84-87276-91-0.) 2014. p. 3. - 20.
  • GAGO BADENAS, Federico; MENÉNDEZ-ARIAS , Luis; "Antiviral Agents: Structural Basis of Action and Rational Design". Structure and Physics of Viruses (serie) . (ISBN: 978-94-007-6551-1.) 2013. p. 599. - 630.
  • GAGO BADENAS, Federico; "Fármacos ansiolíticos e hipnóticos". Terapéutica farmacológica de los trastornos del sistema nervioso. Programa de actualización en Farmacología y Farmacoterapia.. (ISBN: 978-84-87276-75-0.) 2012. p. 301. - 318.
  • GAGO BADENAS, Federico; MORREALE DE LEÓN, Antonio; "COMparative BINding Energy (COMBINE) analysis as a structure-based 3D-QSAR method ". Physico-Chemical and Computational Approaches to Drug Discovery. (ISBN: 978-1849733533.) 2012. p. 244. - 272.
  • GAGO BADENAS, Federico; MORREALE DE LEÓN, Antonio; "COMparative BINding Energy (COMBINE) Analysis as a Structure-Based 3D-QSAR Method". Physico-Chemical and Computational Approaches to Drug Discovery . (ISBN: 978-1-84973-353-3.) 2012. p. 244. - 272.
  • GAGO BADENAS, Federico; MORENO , Sergio; "Trabectedin". Encyclopedia of Cancer. 2+" ed.". (ISBN: 978-3-540-36847-2.) 2009. p. 3016. - 3020.
  • GAGO BADENAS, Federico; "Fundamentos Moleculares de la Interacción Fármaco-Receptor". Farmacología Básica y Clínica "Velázquez". XVII / XVIII+" ed.". (ISBN: 84-7903-722-9.) 2009. p. 59. - 73.


Congresos

  • GARCÍA MARIN, Javier; ALAJARÍN FERRÁNDEZ, Ramón; RODRÍGUEZ PUYOL, Manuel; VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; PEREIRA QUEVEDO, Sandra; VAQUERO LÓPEZ, Juan José; ."Design of New Alosteric Inhibitors of PTP-1B". Jornada. Internacional. "IV Symposium of Medicinal Chemistry Young Researchers". Barcelona (19/05/2017 - 19/05/2017).
  • GARCÍA MARIN, Javier; ALAJARÍN FERRÁNDEZ, Ramón; VAQUERO LÓPEZ, Juan J.; ÁLVAREZ-BUILLA GÓMEZ, Julio; RODRÍGUEZ PUYOL, Diego; RODRÍGUEZ PUYOL, Manuel; GRIERA MERINO, Mercedes; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Pyridazino[2,3-a]pyrrolo[1,2-c]quinoxalinium salts: potent and selective leishmanicidalsthat show inhibition of L. infantum trypanothione reductase and human protein tyrosine phosphatase 1B". Congreso. Internacional. "Pyridazino[2,3-a]pyrrolo[1,2-c]quinoxalinium salts: potent and selective leishmanicidals that show inhibition of L. infantum trypanothione reductase and human protein tyrosine phosphatase 1B". (17/11/2016 - 18/11/2017).
  • LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; TORO , Miguel; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro; RUIZ SANTAQUITERIA, Marta; GAMO , Ana; CAMARASA , María José; VELÁZQUEZ , Sonsoles; GAGO BADENAS, Federico; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."PEPTIDE FOLDAMERS WITH CELL PENETRATING CAPACITY TARGETING THE DIMERIZATION INTERFACE OF LEISHMANIA INFANTUM TRYPANOTHIONE REDUCTASE". Nacional. "Medicinal Chemistry of Tropical Diseases XII SEQT Symposium III Spanish/Portuguese/Brazilian Meeting". (17/11/2016 - 18/11/2016).
  • RUIZ SANTAQUITERIA, Marta; GAMO , Ana; TORO , Miguel; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro; DE ANABITARTE , Marina; GAGO BADENAS, Federico; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; CAMARASA , María José; VELÁZQUEZ , Sonsoles; ."DESIGN AND SYNTHESIS OF PROTEOMIMETICS TO INHIBIT THE DIMERIZATION INTERFACE OF TRYPANOTHIONE REDUCTASE OF LEISHMANIA INFANTUM". Nacional. "Medicinal Chemistry of Tropical Diseases XII SEQT Symposium III Spanish/Portuguese/Brazilian Meeting". (17/11/2016 - 18/11/2016).
  • REVUELTO , Alejandro; RUIZ SANTAQUITERIA, Marta; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro; TORO , Miguel; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; GAGO BADENAS, Federico; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; CAMARASA , María José; VELÁZQUEZ , Sonsoles; ."A proteomimetic approach to disrupt protein-protein interactions of trypanothione reductase of Leishmania infantum". Internacional. "15 Iberian Peptide Meeting". (10/02/2016 - 12/02/2016).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; GAGO BADENAS, Federico; ."A proteomimetic approach to disrupt protein-protein interactions of trypanothione reductase from Leishmania infantum". Congreso. Europeo. "16th iberian peptide meeting". Oporto "(Portugal)". (10/02/2016 - 12/02/2016).
  • SANMARTÍN SALINAS, Patricia; TORO LONDOÑO, Miguel Ángel; CHAPARRO , Maria; HERNÁNDEZ BREIJO, Francisco de Borja; CANO MARTINEZ, David; ROMÁN CURTO, Irene de los Dolores; GISBERT , Javier; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; NOGUERALES FRAGUAS, Fernando; GONZÁLEZ GUIJARRO, Luis A.; ."Regulation of G1/S checkpoint by insulin receptor substrate-4 in colon cancer cells and its possible involvement in colorectal cancer". Internacional. "AGA 2015 Congress". Washington "(Estados Unidos)". (2015 - 2015).
  • SANMARTÍN SALINAS, Patricia; TORO LONDOÑO, Miguel Ángel; HERNÁNDEZ BREIJO, Francisco de Borja; CANO MARTINEZ, David; ROMÁN CURTO, Irene de los Dolores; CHAPARRO , Maria; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; GISBERT , Javier; NOGUERALES FRAGUAS, Fernando; GONZÁLEZ GUIJARRO, Luis A.; ."Regulación del punto de restricción G1/S por el sustrato del receptor de insulina-4 en las células de cáncer de colon y su posible implicación en el cáncer colorectal.". Nacional. "AEG 2015 Congress". Madrid (2015 - 2015).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; GAGO BADENAS, Federico; ."Effect of the covalent closure on the activity of cyclic peptides:Hydrocarbon- vs. lactam-bridged derivatives as dimerizationinhibitors of Leishmania infantum trypanothione reductase". Congreso. Internacional. "CRC1093 International Symposium „Supramolecular Chemistry on Proteins". Essen "(Alemania)". (29/09/2015 - 30/09/2015).
  • SÁNCHEZ MURCIA, Pedro; RUIZ SANTAQUITERIA, Marta; TORO , Miguel; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; JIMÉNEZ , María Ángeles; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; CAMARASA , María José; GAGO BADENAS, Federico; VELÁZQUEZ , Sonsoles; ."Effect of the covalent closure on the activity of cyclic peptides: Hydrocarbon- vs. lactam-bridged derivatives as dimerization inhibitors of Leishmania infantum trypanothione reductase". Simposio. Internacional. "CRC 1093 International Symposium". (29/09/2015 - 30/09/2015).
  • GAMO , Ana; RUIZ SANTAQUITERIA, Marta; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro; TORO , Miguel; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; GAGO BADENAS, Federico; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; CAMARASA , María José; VELÁZQUEZ , Sonsoles; ."PEPTIDE FOLDAMERS: POTENT DIMERIZATIONINHIBITORS OF LEISHMANIA INFANTUM TRYPANOTHIONEREDUCTASE WITH IMPROVED PROTEOLYTIC STABILITY". Nacional. "II Simposio de Jóvenes Investigadores de la Sociedad Española de Química Terapéutica". (12/06/2015 - 12/06/2015).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."alfa/beta3-PEPTIDE FOLDAMERS: POTENT DIMERIZATION INHIBITORS OF LEISHMANIA INFANTUM TRYPANOTHIONE REDUCTASE WITH IMPROVED PROTEOLYTIC STABILITY". Congreso. Nacional. "II Simposio de jóvenes investigadores de la sociedad española de quimica terapéutica". Madrid (12/06/2015 - 12/06/2015).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."ON THE WAY TO THE DESIGN AND SYNTHESIS OFPROTEOMIMETICS AS DIMERIZATION INHIBITORS OFTRYPANOTHIONE REDUCTASE OF LEISHMANIA INFANTUM.". Congreso. Nacional. "II simposio de jóvenes investigadores de la sociedad española de química terapéutica". Madrid (12/06/2015 - 12/06/2015).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."NOVEL DRUG DESIGN STRATEGIES FOR TRYPANOSOMATID-CAUSING DISEASES: A STRUCTURAL APPROACH". Congreso. Nacional. "II simposio de jóvenes investigadores de la sociedad española de química terapéutica". Madrid (12/06/2015 - 12/06/2015).
  • CARRILES LINARES, Alejandra; TORO , Miguel; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro; LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; RUIZ SANTAQUITERIA, Marta; CAMARASA , María José; GAGO BADENAS, Federico; VELÁZQUEZ , Sonsoles; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; HERMOSO , Juan; ."NOVEL DRUG DESIGN STRATEGIES FOR TRYPANOSOMATID-CAUSING DISEASES: A STRUCTURAL APPROACH". Nacional. "II Simposio de Jóvenes Investigadores de la Sociedad Española de Química Terapéutica". (12/06/2015 - 12/06/2015).
  • GAGO BADENAS, Federico; FRUTOS GAITE, Luis Manuel; ."XIVth International Congress of SBE (Sociedad de Biofísica de España)". UNIVERSIDAD ALCALÁ. (11/06/2014 - 13/06/2014).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; GAGO BADENAS, Federico; RUIZ-SANTAQUITERIA , Marta; TORO LONDOÑO, Miguel; ."Hydrocarbon- and amide-bridge cyclic peptides as dimerization inhibitors of Leishmania infantum trypanothione reductase. ". Congreso. Nacional. "I SIMPOSIO DE JÓVENES INVESTIGADORES DE LA SEQT". (09/05/2014 - 09/05/2014).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Hydrocarbon-stapled peptides targeting the dimerization interface of Leishmania infantum trypanothione reductase". Congreso. Internacional. "MedChem 2013 anual one-day meeting on Medicinal Chemistry of KVCV and SRC. Constrained peptides and macrocycles-new opportunities for drug discovery". Beerse "(Bélgica)". (22/11/2013 - 22/11/2013).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Inhibitions of protein-protein interactions in trypanothione reductase (TryR) of Leishmania infantum: an innovative strategy". Nacional. "XVII national meeting SEQT". Madrid (02/10/2013 - 04/10/2013).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; ."Structure-based domain assignment in Leishmania infantum EndoG and characterization of a pH-dependent regulatory switch". Nacional. Madrid (03/09/2013 - 06/09/2013).  
  • SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; BUEREN-CALABUIG , Juan; CAMACHO-ARTACHO , Marta; GAGO BADENAS, Federico; ."In silico simulation of 4-methylidene-imidazole-5-one (MIO) formation in histidine ammonia-lyase (HAL)". Nacional. "XXXVI Congress of the Spanish Society of Biochemistry". Madrid (03/09/2013 - 03/09/2013).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Disrupting the dimeric form of Leishmania infantum Trypanothione Reductase with site-directed mutagenesis and short peptides". Congreso. Nacional. "XXXVI Congreso de la SEBBM". Madrid (03/09/2013 - 06/09/2013).  
  • LUCIO ORTEGA, Héctor Elessar de; GENES ROBLES, Carlos Mario; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro; GAGO BADENAS, Federico; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Apoptotic-like function of Leishmania p32 protein in Saccharomycescerevisiae". Nacional. (03/09/2013 - 06/09/2013).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; SÁNCHEZ MURCIA, Pedro Alejandro; ."Apoptotic-like function of Leishmania p32 protein in Saccharomyces cerevisiae". Congreso. Nacional. "XXXVI Congreso de la SEBBM ". Madrid (03/09/2013 - 06/09/2013).
  • JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; ."Synthesis and biological evaluation of dimerization inhibitors of trypanothione reductase of Leishmania infantum". Nacional. "III SEQT summer school". Tres Cantos (25/07/2013 - 27/07/2013).
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  • BUEREN CALABUIG, Juan Antonio; RICO VIDAL, Eva; OLIVA CORREIA, Cristina; JIMÉNEZ RUIZ, Antonio; GAGO BADENAS, Federico; ."Structural insights into Leishmania infantum endoG active site and analysis of the reaction mechanism ". Congreso. Internacional. "Second Iberic Meeting on Medicinal Chemistry: G rotein-Coupled Receptors and Enzymes in Drug Discovery ". Oporto "(Portugal)". (12/06/2011 - 15/06/2011).
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Vicerrectorado de Investigación y Transferencia

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